Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTGFP29279 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTGFP29279 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CTGFP29279 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTGFP29279 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTGFP29279 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTGFP29279 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTGFP29279 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTGFP29279 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTGFP29279 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CTGFP29279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTGFP29279 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTGFP29279 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CTGFP29279 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTGFP29279 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTGFP29279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTGFP29279 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CTGFP29279 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTGFP29279 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTGFP29279 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTGFP29279 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTGFP29279 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTGFP29279 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTGFP29279 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTGFP29279 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTGFP29279 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTGFP29279 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTGFP29279 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTGFP29279 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTGFP29279 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTGFP29279 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTGFP29279 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTGFP29279 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTGFP29279 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTGFP29279 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTGFP29279 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTGFP29279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTGFP29279 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTGFP29279 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTGFP29279 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTGFP29279 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTGFP29279 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTGFP29279 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTGFP29279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTGFP29279 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTGFP29279 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTGFP29279 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTGFP29279 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTGFP29279 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTGFP29279 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTGFP29279 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTGFP29279 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTGFP29279 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTGFP29279 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTGFP29279 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTGFP29279 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTGFP29279 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTGFP29279 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTGFP29279 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CTGFP29279 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms