Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PTPRMP28827 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRMP28827 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRMP28827 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRMP28827 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
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