Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PTPRGP23470 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PTPRGP23470 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PTPRGP23470 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms