Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SDHBP21912 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHBP21912 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHBP21912 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHBP21912 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHBP21912 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SDHBP21912 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SDHBP21912 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SDHBP21912 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDHBP21912 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDHBP21912 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDHBP21912 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDHBP21912 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHBP21912 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHBP21912 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHBP21912 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHBP21912 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDHBP21912 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHBP21912 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHBP21912 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHBP21912 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHBP21912 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHBP21912 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHBP21912 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDHBP21912 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHBP21912 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms