Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCF2P10911 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCF2P10911 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCF2P10911 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2P10911 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2P10911 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2P10911 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCF2P10911 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2P10911 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2P10911 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2P10911 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2P10911 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2P10911 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCF2P10911 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCF2P10911 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCF2P10911 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCF2P10911 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCF2P10911 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2P10911 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2P10911 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2P10911 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2P10911 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2P10911 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2P10911 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCF2P10911 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2P10911 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2P10911 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MCF2P10911 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2P10911 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2P10911 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2P10911 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2P10911 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2P10911 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MCF2P10911 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCF2P10911 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCF2P10911 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms