Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
GLI3P10071 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GLI3P10071 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
GLI3P10071 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
GLI3P10071 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GLI3P10071 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GLI3P10071 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GLI3P10071 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GLI3P10071 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GLI3P10071 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GLI3P10071 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GLI3P10071 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GLI3P10071 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GLI3P10071 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GLI3P10071 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GLI3P10071 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GLI3P10071 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GLI3P10071 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
GLI3P10071 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GLI3P10071 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GLI3P10071 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GLI3P10071 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
GLI3P10071 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GLI3P10071 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GLI3P10071 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GLI3P10071 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GLI3P10071 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GLI3P10071 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GLI3P10071 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GLI3P10071 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GLI3P10071 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
GLI3P10071 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
GLI3P10071 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GLI3P10071 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GLI3P10071 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GLI3P10071 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GLI3P10071 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
GLI3P10071 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
GLI3P10071 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
GLI3P10071 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms