Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C4AP0C0L4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C4AP0C0L4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
C4AP0C0L4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms