Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UFL1O94874 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UFL1O94874 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
UFL1O94874 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UFL1O94874 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UFL1O94874 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
UFL1O94874 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UFL1O94874 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UFL1O94874 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UFL1O94874 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UFL1O94874 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UFL1O94874 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UFL1O94874 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UFL1O94874 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UFL1O94874 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UFL1O94874 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
UFL1O94874 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UFL1O94874 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UFL1O94874 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UFL1O94874 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UFL1O94874 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
UFL1O94874 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
UFL1O94874 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
UFL1O94874 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
UFL1O94874 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UFL1O94874 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UFL1O94874 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UFL1O94874 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UFL1O94874 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
UFL1O94874 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
UFL1O94874 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
UFL1O94874 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UFL1O94874 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UFL1O94874 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UFL1O94874 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UFL1O94874 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
UFL1O94874 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UFL1O94874 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UFL1O94874 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UFL1O94874 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UFL1O94874 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
UFL1O94874 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
UFL1O94874 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
UFL1O94874 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
UFL1O94874 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
UFL1O94874 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UFL1O94874 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UFL1O94874 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UFL1O94874 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UFL1O94874 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UFL1O94874 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UFL1O94874 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UFL1O94874 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UFL1O94874 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UFL1O94874 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UFL1O94874 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
UFL1O94874 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UFL1O94874 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UFL1O94874 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UFL1O94874 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms