Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20BO75063 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM20BO75063 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20BO75063 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAM20BO75063 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20BO75063 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20BO75063 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAM20BO75063 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FAM20BO75063 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM20BO75063 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms