Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.675e-7■■■■■ 27.8
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PRPF4O43172 ZNF692-208ENST00000470787 1544 ntTSL 222.32■■□□□ 1.165e-7■■■■■ 27.8
PRPF4O43172 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 27.8
PRPF4O43172 ZNF692-220ENST00000496411 1064 ntTSL 320.04■□□□□ 0.85e-7■■■■■ 27.8
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PRPF4O43172 PUM2-205ENST00000420234 562 ntTSL 54.54□□□□□ -1.682e-8■■■■■ 27.7
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PRPF4O43172 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.756e-9■■■■■ 27.7
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PRPF4O43172 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.746e-9■■■■■ 27.7
PRPF4O43172 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 325.03■■□□□ 1.66e-9■■■■■ 27.7
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PRPF4O43172 ALDOA-214ENST00000564688 613 ntTSL 510.97□□□□□ -0.652e-8■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 ALDOA-218ENST00000566146 365 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MTG2-207ENST00000471352 785 ntTSL 515.5■□□□□ 0.078e-12■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MTG2-206ENST00000467101 2814 ntTSL 1 (best)15.02□□□□□ -0.018e-12■■■■■ 27.5
PRPF4O43172 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.068e-12■■■■■ 27.5
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