Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLOD2O00469 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLOD2O00469 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms