Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HIP1O00291 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIP1O00291 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIP1O00291 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIP1O00291 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIP1O00291 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HIP1O00291 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIP1O00291 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIP1O00291 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HIP1O00291 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HIP1O00291 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HIP1O00291 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIP1O00291 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HIP1O00291 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HIP1O00291 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIP1O00291 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIP1O00291 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HIP1O00291 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIP1O00291 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HIP1O00291 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIP1O00291 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HIP1O00291 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIP1O00291 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HIP1O00291 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIP1O00291 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIP1O00291 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIP1O00291 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIP1O00291 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HIP1O00291 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIP1O00291 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HIP1O00291 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIP1O00291 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIP1O00291 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HIP1O00291 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIP1O00291 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIP1O00291 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HIP1O00291 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HIP1O00291 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIP1O00291 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIP1O00291 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIP1O00291 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HIP1O00291 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIP1O00291 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HIP1O00291 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIP1O00291 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIP1O00291 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIP1O00291 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIP1O00291 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HIP1O00291 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIP1O00291 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIP1O00291 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIP1O00291 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIP1O00291 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIP1O00291 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HIP1O00291 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms