Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NFKBIEO00221 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NFKBIEO00221 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms