Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GMNCA6NCL1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GMNCA6NCL1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GMNCA6NCL1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms