Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTAGE9A4FU28 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTAGE9A4FU28 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms