Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYCE3A1L190 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYCE3A1L190 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYCE3A1L190 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms