Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPC1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPC1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A1W2PPC1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1W2PPC1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PPC1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms