Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TNPO3Q9Y5L0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms