Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IFT52Q9Y366 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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IFT52Q9Y366 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
IFT52Q9Y366 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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