Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KDM2AQ9Y2K7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KDM2AQ9Y2K7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms