Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS3Q9UNS2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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COPS3Q9UNS2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
COPS3Q9UNS2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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