Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRPF3Q9ULD4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms