Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms