Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VAPAQ9P0L0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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