Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GIN1Q9NXP7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
GIN1Q9NXP7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms