Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 LINC00893-215ENST00000618757 2347 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PEX12-201ENST00000225873 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
SNHG12Q9BXW3 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL139011.2-201ENST00000556710 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SNHG12Q9BXW3 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms