Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BBS2Q9BXC9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms