Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLVAPQ9BX97 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms