Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PI4K2AQ9BTU6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms