Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCNX1Q96RV3 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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