Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C9orf72Q96LT7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms