Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
APOBEC4Q8WW27 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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