Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIEQ8NEW7 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms