Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RNF148Q8N7C7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RNF148Q8N7C7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms