Protein–RNA interactions for Protein: Q8N129

CNPY4, Protein canopy homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY4Q8N129 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNPY4Q8N129 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms