Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SUSD1Q6UWL2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms