Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL354919.1-201ENST00000453837 2257 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL022476.1-201ENST00000443063 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC01583-202ENST00000558082 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
C16orf54Q6UWD8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms