Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZBED9Q6R2W3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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