Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRAF7Q6Q0C0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRAF7Q6Q0C0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms