Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BRMS1LQ5PSV4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms