Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FREM1Q5H8C1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FREM1Q5H8C1 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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