Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC38Q502W7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC38Q502W7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms