Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC96Q2M329 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms