Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SGCAQ16586 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms