Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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PCSK7Q16549 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCSK7Q16549 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCSK7Q16549 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCSK7Q16549 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCSK7Q16549 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCSK7Q16549 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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PCSK7Q16549 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCSK7Q16549 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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