Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NPTX1Q15818 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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