Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TCEA2Q15560 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TCEA2Q15560 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms