Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN1Q14699 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms