Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ALCAMQ13740 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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