Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHAF1AQ13111 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
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